Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTN2P35609 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms