Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP5DP30049 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms