Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ARID4AP29374 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms