Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DMAP28067 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms