Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PLNP26678 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PLNP26678 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PLNP26678 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PLNP26678 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PLNP26678 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PLNP26678 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PLNP26678 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PLNP26678 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PLNP26678 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PLNP26678 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PLNP26678 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PLNP26678 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PLNP26678 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PLNP26678 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PLNP26678 GPR173-201ENST00000332582 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PLNP26678 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PLNP26678 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PLNP26678 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PLNP26678 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PLNP26678 PDE12-201ENST00000311180 8773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PLNP26678 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PLNP26678 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PLNP26678 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PLNP26678 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PLNP26678 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PLNP26678 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PLNP26678 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PLNP26678 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PLNP26678 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PLNP26678 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PLNP26678 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PLNP26678 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PLNP26678 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PLNP26678 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PLNP26678 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PLNP26678 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PLNP26678 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PLNP26678 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PLNP26678 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PLNP26678 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PLNP26678 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PLNP26678 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PLNP26678 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PLNP26678 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PLNP26678 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PLNP26678 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PLNP26678 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PLNP26678 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PLNP26678 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PLNP26678 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PLNP26678 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PLNP26678 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PLNP26678 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PLNP26678 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PLNP26678 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PLNP26678 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PLNP26678 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PLNP26678 VPS13A-204ENST00000376634 10269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PLNP26678 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PLNP26678 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PLNP26678 GFRA1-204ENST00000439649 9216 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PLNP26678 ABCA3-202ENST00000382381 6446 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PLNP26678 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PLNP26678 DOT1L-201ENST00000398665 7436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PLNP26678 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PLNP26678 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PLNP26678 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PLNP26678 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PLNP26678 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PLNP26678 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PLNP26678 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PLNP26678 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PLNP26678 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PLNP26678 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PLNP26678 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PLNP26678 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PLNP26678 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PLNP26678 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PLNP26678 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PLNP26678 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PLNP26678 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PLNP26678 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PLNP26678 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PLNP26678 ZCCHC14-201ENST00000268616 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PLNP26678 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PLNP26678 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PLNP26678 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PLNP26678 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PLNP26678 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PLNP26678 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PLNP26678 FOXK1-201ENST00000328914 11181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PLNP26678 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PLNP26678 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PLNP26678 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PLNP26678 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PLNP26678 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PLNP26678 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PLNP26678 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PLNP26678 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms