Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTSSP25774 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTSSP25774 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTSSP25774 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTSSP25774 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTSSP25774 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTSSP25774 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTSSP25774 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTSSP25774 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTSSP25774 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTSSP25774 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTSSP25774 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTSSP25774 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTSSP25774 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTSSP25774 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTSSP25774 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTSSP25774 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTSSP25774 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTSSP25774 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTSSP25774 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTSSP25774 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTSSP25774 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTSSP25774 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTSSP25774 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTSSP25774 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTSSP25774 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTSSP25774 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTSSP25774 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTSSP25774 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTSSP25774 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTSSP25774 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTSSP25774 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTSSP25774 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTSSP25774 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTSSP25774 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTSSP25774 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTSSP25774 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTSSP25774 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTSSP25774 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CTSSP25774 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTSSP25774 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTSSP25774 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CTSSP25774 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CTSSP25774 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTSSP25774 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CTSSP25774 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTSSP25774 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTSSP25774 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTSSP25774 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTSSP25774 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTSSP25774 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTSSP25774 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTSSP25774 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTSSP25774 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTSSP25774 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTSSP25774 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTSSP25774 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTSSP25774 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTSSP25774 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTSSP25774 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTSSP25774 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTSSP25774 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTSSP25774 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTSSP25774 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTSSP25774 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTSSP25774 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTSSP25774 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTSSP25774 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTSSP25774 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTSSP25774 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTSSP25774 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTSSP25774 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTSSP25774 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTSSP25774 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTSSP25774 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTSSP25774 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTSSP25774 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTSSP25774 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTSSP25774 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTSSP25774 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTSSP25774 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTSSP25774 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTSSP25774 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTSSP25774 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTSSP25774 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTSSP25774 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTSSP25774 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTSSP25774 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTSSP25774 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTSSP25774 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTSSP25774 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CTSSP25774 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTSSP25774 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CTSSP25774 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTSSP25774 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTSSP25774 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTSSP25774 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CTSSP25774 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTSSP25774 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CTSSP25774 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms