Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XPAP23025 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XPAP23025 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XPAP23025 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XPAP23025 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XPAP23025 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XPAP23025 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XPAP23025 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XPAP23025 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XPAP23025 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XPAP23025 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XPAP23025 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XPAP23025 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XPAP23025 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XPAP23025 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XPAP23025 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XPAP23025 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XPAP23025 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XPAP23025 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XPAP23025 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
XPAP23025 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XPAP23025 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XPAP23025 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XPAP23025 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XPAP23025 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XPAP23025 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XPAP23025 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XPAP23025 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XPAP23025 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XPAP23025 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XPAP23025 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XPAP23025 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XPAP23025 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XPAP23025 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XPAP23025 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XPAP23025 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XPAP23025 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XPAP23025 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XPAP23025 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XPAP23025 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XPAP23025 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XPAP23025 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XPAP23025 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XPAP23025 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XPAP23025 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XPAP23025 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
XPAP23025 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XPAP23025 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XPAP23025 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XPAP23025 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XPAP23025 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XPAP23025 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XPAP23025 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XPAP23025 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XPAP23025 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XPAP23025 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XPAP23025 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XPAP23025 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XPAP23025 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XPAP23025 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
XPAP23025 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XPAP23025 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XPAP23025 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XPAP23025 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XPAP23025 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XPAP23025 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XPAP23025 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XPAP23025 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XPAP23025 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XPAP23025 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XPAP23025 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XPAP23025 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XPAP23025 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XPAP23025 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XPAP23025 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XPAP23025 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XPAP23025 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XPAP23025 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XPAP23025 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XPAP23025 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XPAP23025 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
XPAP23025 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XPAP23025 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XPAP23025 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XPAP23025 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XPAP23025 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XPAP23025 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XPAP23025 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XPAP23025 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XPAP23025 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XPAP23025 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XPAP23025 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XPAP23025 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XPAP23025 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XPAP23025 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XPAP23025 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XPAP23025 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XPAP23025 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XPAP23025 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
XPAP23025 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms