Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FGFR3P22607 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms