Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP2A2P16615 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms