Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPB42P16452 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPB42P16452 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPB42P16452 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPB42P16452 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPB42P16452 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPB42P16452 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPB42P16452 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPB42P16452 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPB42P16452 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPB42P16452 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPB42P16452 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPB42P16452 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPB42P16452 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPB42P16452 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPB42P16452 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPB42P16452 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPB42P16452 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
EPB42P16452 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPB42P16452 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPB42P16452 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPB42P16452 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPB42P16452 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPB42P16452 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
EPB42P16452 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPB42P16452 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPB42P16452 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPB42P16452 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
EPB42P16452 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
EPB42P16452 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPB42P16452 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPB42P16452 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPB42P16452 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPB42P16452 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPB42P16452 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPB42P16452 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
EPB42P16452 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPB42P16452 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
EPB42P16452 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
EPB42P16452 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPB42P16452 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPB42P16452 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPB42P16452 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPB42P16452 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPB42P16452 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPB42P16452 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPB42P16452 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPB42P16452 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPB42P16452 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPB42P16452 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPB42P16452 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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EPB42P16452 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPB42P16452 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPB42P16452 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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EPB42P16452 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPB42P16452 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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EPB42P16452 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EPB42P16452 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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EPB42P16452 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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EPB42P16452 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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EPB42P16452 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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EPB42P16452 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EPB42P16452 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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EPB42P16452 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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EPB42P16452 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EPB42P16452 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EPB42P16452 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EPB42P16452 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EPB42P16452 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EPB42P16452 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EPB42P16452 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EPB42P16452 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EPB42P16452 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
EPB42P16452 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EPB42P16452 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EPB42P16452 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EPB42P16452 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EPB42P16452 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EPB42P16452 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
EPB42P16452 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
EPB42P16452 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EPB42P16452 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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