Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms