Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
PTPRCP08575 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTPRCP08575 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms