Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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ZBED1O96006 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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ZBED1O96006 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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ZBED1O96006 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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ZBED1O96006 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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ZBED1O96006 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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ZBED1O96006 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZBED1O96006 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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