Protein–RNA interactions for Protein: O75508

CLDN11, Claudin-11, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11O75508 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLDN11O75508 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms