Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EDIL3O43854 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms