Protein–RNA interactions for Protein: O15554

KCNN4, Intermediate conductance calcium-activated potassium channel protein 4, humanhuman

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Length 427 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNN4O15554 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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KCNN4O15554 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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KCNN4O15554 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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KCNN4O15554 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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KCNN4O15554 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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KCNN4O15554 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNN4O15554 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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