Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CTDSP2O14595 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 405.5 ms