Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EBAG9O00559 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EBAG9O00559 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EBAG9O00559 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EBAG9O00559 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EBAG9O00559 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EBAG9O00559 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
EBAG9O00559 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EBAG9O00559 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EBAG9O00559 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EBAG9O00559 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EBAG9O00559 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EBAG9O00559 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EBAG9O00559 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EBAG9O00559 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EBAG9O00559 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.05■□□□□ 0
EBAG9O00559 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EBAG9O00559 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC15.05■□□□□ 0
EBAG9O00559 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
EBAG9O00559 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC15.05■□□□□ 0
EBAG9O00559 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
EBAG9O00559 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EBAG9O00559 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EBAG9O00559 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
EBAG9O00559 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EBAG9O00559 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EBAG9O00559 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EBAG9O00559 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EBAG9O00559 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EBAG9O00559 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EBAG9O00559 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EBAG9O00559 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EBAG9O00559 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EBAG9O00559 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
EBAG9O00559 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EBAG9O00559 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EBAG9O00559 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EBAG9O00559 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EBAG9O00559 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EBAG9O00559 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EBAG9O00559 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EBAG9O00559 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EBAG9O00559 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EBAG9O00559 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EBAG9O00559 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EBAG9O00559 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EBAG9O00559 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EBAG9O00559 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EBAG9O00559 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EBAG9O00559 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EBAG9O00559 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EBAG9O00559 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EBAG9O00559 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EBAG9O00559 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EBAG9O00559 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EBAG9O00559 AC015921.1-201ENST00000574885 2546 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EBAG9O00559 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EBAG9O00559 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EBAG9O00559 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EBAG9O00559 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EBAG9O00559 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EBAG9O00559 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EBAG9O00559 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EBAG9O00559 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EBAG9O00559 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EBAG9O00559 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EBAG9O00559 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EBAG9O00559 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EBAG9O00559 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EBAG9O00559 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EBAG9O00559 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EBAG9O00559 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EBAG9O00559 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EBAG9O00559 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
EBAG9O00559 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EBAG9O00559 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EBAG9O00559 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EBAG9O00559 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EBAG9O00559 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EBAG9O00559 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
EBAG9O00559 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EBAG9O00559 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EBAG9O00559 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
EBAG9O00559 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
EBAG9O00559 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EBAG9O00559 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
EBAG9O00559 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
EBAG9O00559 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EBAG9O00559 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EBAG9O00559 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EBAG9O00559 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EBAG9O00559 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EBAG9O00559 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EBAG9O00559 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EBAG9O00559 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EBAG9O00559 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EBAG9O00559 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EBAG9O00559 SH2D5-201ENST00000375031 3705 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EBAG9O00559 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EBAG9O00559 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms