Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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C4orf47A7E2U8 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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C4orf47A7E2U8 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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C4orf47A7E2U8 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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C4orf47A7E2U8 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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C4orf47A7E2U8 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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C4orf47A7E2U8 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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C4orf47A7E2U8 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C4orf47A7E2U8 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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