Protein–RNA interactions for Protein: A0AVT1

UBA6, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA6A0AVT1 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBA6A0AVT1 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms