Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms