Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP2

IQSEC3, IQ motif and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQSEC3Q9UPP2 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
IQSEC3Q9UPP2 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms