Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
COPS3Q9UNS2 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms