Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PALD1Q9ULE6 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms