Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
APEX2Q9UBZ4 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 245.4 ms