Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
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