Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC17A6Q9P2U8 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms