Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms