Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC3GQ9HC16 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms