Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms