Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS1

KRTAP1-5, Keratin-associated protein 1-5, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-5Q9BYS1 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP1-5Q9BYS1 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms