Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY10

SLC46A2, Thymic stromal cotransporter homolog, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A2Q9BY10 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms