Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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IFT27Q9BW83 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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IFT27Q9BW83 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
IFT27Q9BW83 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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