Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUK0

CHCHD7, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 7, humanhuman

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD7Q9BUK0 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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CHCHD7Q9BUK0 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CHCHD7Q9BUK0 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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