Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms