Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RPS6KC1Q96S38 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPS6KC1Q96S38 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms