Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms