Protein–RNA interactions for Protein: Q92537

SUSD6, Sushi domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD6Q92537 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUSD6Q92537 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms