Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWQ0

PHIP, PH-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHIPQ8WWQ0 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PHIPQ8WWQ0 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms