Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBC4

UBA3, NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit, humanhuman

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA3Q8TBC4 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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