Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMO3Q8TAP4 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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