Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMNTD2Q8IXW0 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms