Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms