Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAB11FIP4Q86YS3 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms