Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PBRM1Q86U86 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms