Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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TRAPPC6BQ86SZ2 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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TRAPPC6BQ86SZ2 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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TRAPPC6BQ86SZ2 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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