Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NUP54Q7Z3B4 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NUP54Q7Z3B4 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NUP54Q7Z3B4 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NUP54Q7Z3B4 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NUP54Q7Z3B4 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NUP54Q7Z3B4 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
NUP54Q7Z3B4 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NUP54Q7Z3B4 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NUP54Q7Z3B4 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NUP54Q7Z3B4 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
NUP54Q7Z3B4 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NUP54Q7Z3B4 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NUP54Q7Z3B4 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NUP54Q7Z3B4 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NUP54Q7Z3B4 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NUP54Q7Z3B4 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
NUP54Q7Z3B4 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NUP54Q7Z3B4 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NUP54Q7Z3B4 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NUP54Q7Z3B4 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NUP54Q7Z3B4 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NUP54Q7Z3B4 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NUP54Q7Z3B4 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NUP54Q7Z3B4 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NUP54Q7Z3B4 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NUP54Q7Z3B4 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
NUP54Q7Z3B4 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NUP54Q7Z3B4 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NUP54Q7Z3B4 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
NUP54Q7Z3B4 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NUP54Q7Z3B4 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
NUP54Q7Z3B4 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
NUP54Q7Z3B4 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
NUP54Q7Z3B4 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NUP54Q7Z3B4 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
NUP54Q7Z3B4 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NUP54Q7Z3B4 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NUP54Q7Z3B4 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
NUP54Q7Z3B4 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
NUP54Q7Z3B4 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
NUP54Q7Z3B4 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NUP54Q7Z3B4 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP54Q7Z3B4 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP54Q7Z3B4 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP54Q7Z3B4 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP54Q7Z3B4 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP54Q7Z3B4 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP54Q7Z3B4 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP54Q7Z3B4 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP54Q7Z3B4 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP54Q7Z3B4 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP54Q7Z3B4 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP54Q7Z3B4 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP54Q7Z3B4 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP54Q7Z3B4 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP54Q7Z3B4 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP54Q7Z3B4 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP54Q7Z3B4 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP54Q7Z3B4 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP54Q7Z3B4 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP54Q7Z3B4 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP54Q7Z3B4 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP54Q7Z3B4 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP54Q7Z3B4 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP54Q7Z3B4 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP54Q7Z3B4 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP54Q7Z3B4 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP54Q7Z3B4 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP54Q7Z3B4 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP54Q7Z3B4 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP54Q7Z3B4 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP54Q7Z3B4 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP54Q7Z3B4 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP54Q7Z3B4 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP54Q7Z3B4 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP54Q7Z3B4 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP54Q7Z3B4 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP54Q7Z3B4 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP54Q7Z3B4 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP54Q7Z3B4 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP54Q7Z3B4 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP54Q7Z3B4 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP54Q7Z3B4 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP54Q7Z3B4 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP54Q7Z3B4 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP54Q7Z3B4 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP54Q7Z3B4 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP54Q7Z3B4 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP54Q7Z3B4 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP54Q7Z3B4 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP54Q7Z3B4 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP54Q7Z3B4 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP54Q7Z3B4 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP54Q7Z3B4 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP54Q7Z3B4 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP54Q7Z3B4 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP54Q7Z3B4 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP54Q7Z3B4 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NUP54Q7Z3B4 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms