Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms