Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A3

ZNF549, Zinc finger protein 549, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF549Q6P9A3 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF549Q6P9A3 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms