Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4E1

CASC4, Protein CASC4, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC4Q6P4E1 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms